RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 MCTP2Q6DN12 878 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 BORAQ6PGQ7 559 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 EEPD1Q7L9B9 569 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 LGI4Q8N135 537 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 EPN3Q9H201 632 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFCD-210ENST00000490205 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PLATP00750 562 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CR1LQ2VPA4 569 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PRR31Q5SQ13 230 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 STEAP3Q658P3 488 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CLDND1Q9NY35 253 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 DGKIO75912 1065 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 LCP1P13796 627 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 INSRRP14616 1297 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 DTLQ9NZJ0 730 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TADA3O75528 432 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 GJB6O95452 261 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ARID5AQ03989 594 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ADAM9Q13443 819 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 EMC4Q5J8M3 183 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 C1orf159Q96HA4 380 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 INVSQ9Y283 1065 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 C9orf118A6NHY6 69 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF536O15090 1300 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MAFKO60675 156 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CYP7B1O75881 506 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 FGRP09769 529 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PPP2R2AP63151 447 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ADAM17P78536 824 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MAP4K2Q12851 820 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 SLC10A6Q3KNW5 377 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 LOXL4Q96JB6 756 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 SAMD11Q96NU1 681 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CLIC6Q96NY7 704 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CAPNS1P04632 268 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF28P17035 718 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 GRIA2P42262 883 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 SURF1Q15526 300 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TEPPQ6URK8 271 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 WRNIP1Q96S55 665 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM209Q96SK2 561 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MYOTQ9UBF9 498 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 A0A1W2PQU0 124 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 KRIT1O00522 736 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 LRG1P02750 347 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 IL13P35225 146 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CPZQ66K79 652 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 PLEKHH3Q7Z736 793 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TINF2Q9BSI4 451 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 IER2Q9BTL4 223 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 GPR27Q9NS67 375 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFCD-210ENST00000490205 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 CHST13Q8NET6 341 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 ST7Q9NRC1 585 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 CROTQ9UKG9 612 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 DLX3O60479 287 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFCD-210ENST00000490205 B4GALT3O60512 393 aa5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms