RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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SOGA3-207ENST00000481848 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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SOGA3-207ENST00000481848 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.44□□□□□ -0.26
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SOGA3-207ENST00000481848 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.44□□□□□ -0.26
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SOGA3-207ENST00000481848 S100A1P23297 94 aa13.43□□□□□ -0.26
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SOGA3-207ENST00000481848 H2AFZP0C0S5 128 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 H2AFVQ71UI9 128 aa13.43□□□□□ -0.26
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SOGA3-207ENST00000481848 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 TRIM49P0CI25 452 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 TRIM49CP0CI26 452 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 SLC9A1P19634 815 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 TP53BP2Q13625 1128 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 H0YCG3 227 aa13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SOGA3-207ENST00000481848 OCRLQ01968 901 aa13.43□□□□□ -0.26
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