RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC41Q15345 812 aa25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF592Q92610 1267 aa25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 FAM20AQ96MK3 541 aa25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-209ENST00000428120 ABCB11O95342 1321 aa25.89■■□□□ 1.73
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FAAP20-209ENST00000428120 CYP4A11Q02928 519 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 SPP2Q13103 211 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 LPAR1Q92633 364 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 THAP9Q9H5L6 903 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 FLOT1O75955 427 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 ICAM1P05362 532 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 VCAM1P19320 739 aa25.88■■□□□ 1.73
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FAAP20-209ENST00000428120 PTPN14Q15678 1187 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 WRNIP1Q96S55 665 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 VAV3Q9UKW4 847 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 BICDL2A1A5D9 508 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 NFIBO00712 420 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 GPBP1Q86WP2 473 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 UBXN1Q04323 297 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 KCND1Q9NSA2 647 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 GGA3Q9NZ52 723 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 EML1O00423 815 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 CASP14P31944 242 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 EPS15P42566 896 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 COASYQ13057 564 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 ERMNQ8TAM6 284 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 GYPCP04921 128 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 EHHADHQ08426 723 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF15Q66K64 600 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 PANK4Q9NVE7 773 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 CHMP2AO43633 222 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 ALAS1P13196 640 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ6P48051 423 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.732e-7■■■□□ 17.4
FAAP20-209ENST00000428120 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 COL20A1Q9P218 1284 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 TPM2P07951 284 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 RPA1P27694 616 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 RGL1Q9NZL6 768 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP6O43182 974 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 CYP11B2P19099 503 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R2P41236 205 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 SLC12A3P55017 1021 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 CEP55Q53EZ4 464 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 CENPPQ6IPU0 288 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 MFAP3LO75121 409 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 ARSHQ5FYA8 562 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.83■■□□□ 1.73
FAAP20-209ENST00000428120 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.83■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 B4DLN1 442 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 STX10O60499 249 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 LMNB1P20700 586 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 PRKG1Q13976 671 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 WNK4Q96J92 1243 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-209ENST00000428120 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.82■■□□□ 1.72
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