RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SPPL3Q8TCT6 385 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AFG1LQ8WV93 481 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KAT2BQ92831 832 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COPS5Q92905 334 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BORCS6Q96GS4 357 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RTKNQ9BST9 563 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP24Q9UPU5 2620 aa10.22□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MMP3P08254 477 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PDE6AP16499 860 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PSEN2P49810 448 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MUM1L1Q5H9M0 696 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLFN13Q68D06 897 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DCLK2Q8N568 766 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 R4GN57 208 aa10.21□□□□□ -0.77
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.21□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.21□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GPR179Q6PRD1 2367 aa10.21□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PI15O43692 258 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLA2G6O60733 806 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FRYLO94915 3013 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GH1P01241 217 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POF1BQ8WVV4 589 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NECTIN4Q96NY8 510 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ALG1Q9BT22 464 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 S1PR5Q9H228 398 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARMT1Q9H993 441 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRKAB2O43741 272 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CAND2O75155 1236 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTLL1O95922 423 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GNAI2P04899 355 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ITGB1P05556 798 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNAJB1P25685 340 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LMNB2Q03252 620 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MFSD10Q14728 455 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SERINC5Q86VE9 423 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNERQ8NFT8 737 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WNT8BQ93098 351 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NLRC5Q86WI3 1866 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.19□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYO10Q9HD67 2058 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYH8P13535 1937 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HAS3O00219 553 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RASA1P20936 1047 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SP100P23497 879 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EDNRBP24530 442 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC1A4P43007 532 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UBE3AQ05086 875 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANKRD54Q6NXT1 300 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CTR9Q6PD62 1173 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KLHL23Q8NBE8 558 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SOBPA7XYQ1 873 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 C2CD4DB7Z1M9 353 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PER2O15055 1255 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 F2P00734 622 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ICAM1P05362 532 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NPR3P17342 541 aa10.17□□□□□ -0.78
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TECP42680 631 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms