RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380026.7

CENPE-202, Transcript of centromere protein E, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPE, Length 8,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPE-202ENST00000380026 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 PICK1Q9NRD5 415 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 RGL1Q9NZL6 768 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ECE2O60344 883 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 KIAA0754O94854 1291 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SRGNP10124 158 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 KIF11P52732 1056 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SMTNP53814 917 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 CCDC93Q567U6 631 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 XKR9Q5GH70 373 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 RSPH14Q9UHP6 348 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ESYT2A0FGR8 921 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 MYMKA6NI61 221 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SPOPO43791 374 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 LRRN2O75325 713 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 TADA3O75528 432 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 STAT3P40763 770 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FUT2Q10981 343 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 KCNB1Q14721 858 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 NR1I3Q14994 352 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 GBP6Q6ZN66 633 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SFR1Q86XK3 245 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FAM212AQ96EL1 285 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 PLVAPQ9BX97 442 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 C3P01024 1663 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 RHOBTB3O94955 611 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ZNF18P17022 549 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 PLCB3Q01970 1234 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SPP2Q13103 211 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 NAA35Q5VZE5 725 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 MCTP2Q6DN12 878 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FAM186BQ8IYM0 893 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ZNF384Q8TF68 577 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 NEFHP12036 1026 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 IQCDQ96DY2 449 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 KCNK3O14649 394 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FAM133AQ8N9E0 248 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FNBP1Q96RU3 617 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 THAP9Q9H5L6 903 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ZBTB7AO95365 584 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 RHBDL3P58872 404 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 FTCDO95954 541 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ZNF577Q9BSK1 485 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SHTN1A0MZ66 631 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 LRRC53A6NM62 1247 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SRGAP2O75044 1071 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ZBED4O75132 1171 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 AP3B2Q13367 1082 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 PDIA5Q14554 519 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SLC51AQ86UW1 340 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 PIK3C2AO00443 1686 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 K7ENM7 598 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 CALUO43852 315 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 GNA14O95837 355 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 DLATP10515 647 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 CTNNA2P26232 953 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 CEP55Q53EZ4 464 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 CCDC170Q8IYT3 715 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-202ENST00000380026 ACER1Q8TDN7 264 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms