RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364017.1

RNU6-598P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 598, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-598P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-598P-201ENST00000364017 T-ENOLP0DO92 83 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SCP2P22307 547 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 KELP23276 732 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CSRP3P50461 194 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NPY5RQ15761 445 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TIGD2Q4W5G0 525 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 XKR4Q5GH76 650 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CEP85LQ5SZL2 805 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ETV3LQ6ZN32 361 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZNF788Q6ZQV5 615 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 BRAPQ7Z569 592 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 KRT77Q7Z794 578 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CABP7Q86V35 215 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 HID1Q8IV36 788 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LARGE2Q8N3Y3 721 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 D2HGDHQ8N465 521 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 GPBAR1Q8TDU6 330 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SLC9A6Q92581 669 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LMLNQ96KR4 655 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CLIC6Q96NY7 704 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 JMJD8Q96S16 334 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 DPYSL5Q9BPU6 564 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 KCNH6Q9H252 994 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZNF576Q9H609 170 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NRIP3Q9NQ35 241 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SLC7A10Q9NS82 523 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 BTBD3Q9Y2F9 522 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 HS3ST4Q9Y661 456 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FAM90A10PA6NDY2 464 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 EREGO14944 169 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LRRN2O75325 713 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 C1QL1O75973 258 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 RECQL4O94761 1208 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SYPP08247 313 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TACR1P25103 407 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PLA2G5P39877 138 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 RFC5P40937 340 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZAP70P43403 619 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SEC24CP53992 1094 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ETF1P62495 437 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 COX20Q5RI15 118 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 MORN5Q5VZ52 161 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SUSD1Q6UWL2 747 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 Q6ZUG5 572 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FAM26EQ8N5C1 309 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 VGLL2Q8N8G2 317 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 REPS2Q8NFH8 660 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ELMO3Q96BJ8 720 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 COQ10AQ96MF6 247 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CHRDQ9H2X0 955 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LIN7BQ9HAP6 207 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 RXFP1Q9HBX9 757 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ERVK13-1Q9NX77 482 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TMEM260Q9NX78 707 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CROTQ9UKG9 612 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FBN3Q75N90 2809 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 A0A087WYN8 130 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 C4orf47A7E2U8 309 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 PHACTR2O75167 634 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZNF205O95201 554 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 LDLRP01130 860 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 HKR1P10072 659 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 MAN2A2P49641 1150 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 SCNN1GP51170 649 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 SEC13P55735 322 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 CLDN10P78369 228 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 PPP2R3AQ06190 1150 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 BMT2Q1RMZ1 405 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 RABL3Q5HYI8 236 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 CCDC62Q6P9F0 684 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-598P-201ENST00000364017 GPR155Q7Z3F1 870 aa0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms