RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 PLA2G4BP0C869 781 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CYP3A7P24462 503 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 AP3B2Q13367 1082 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 USH1GQ495M9 461 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 IQCDQ96DY2 449 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 MYO6Q9UM54 1294 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 EPHB6O15197 1021 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 PLA2G4AP47712 749 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP4P98171 946 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 MBOAT7Q96N66 472 aa21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 RCCD1A6NED2 376 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 PSMD14O00487 310 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 GH2P01242 217 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 JAG1P78504 1218 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 GPBP1Q86WP2 473 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 FBXO11Q86XK2 927 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.35■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 KRT86O43790 486 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 MED24O75448 989 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 TBC1D8O95759 1140 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CDK17Q00537 523 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 PRR16Q569H4 304 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 GMCL1Q96IK5 515 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ENC1O14682 589 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CTAGE8P0CG41 777 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CYP27A1Q02318 531 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.34■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ATP8B1O43520 1251 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CNKSR1Q969H4 720 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 CCDC42Q96M95 316 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.33■■□□□ 1.01
USP21-201ENST00000289865 POTEFA5A3E0 1075 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 TRAF5O00463 557 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 ENTPD3O75355 529 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 SASH3O75995 380 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 POTEIP0CG38 1075 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 BMP3P12645 472 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 CYP11B2P19099 503 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 POTEGQ6S5H5 508 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.33■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 POTEB2H3BUK9 544 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 SLC26A4O43511 780 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 BRD3Q15059 726 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 CSRNP1Q96S65 589 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.32■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 CCDC151A5D8V7 595 aa21.31■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.31■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.31■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.31■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 PNKPQ96T60 521 aa21.31■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.31■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 ZNF263O14978 683 aa21.31■■□□□ 1
USP21-201ENST00000289865 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms