RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 FAM153BP0C7A2 387 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PDCLQ13371 301 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 GRIK5Q16478 980 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 FAM153CQ494X1 144 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 RAD54LQ92698 747 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 RNF14Q9UBS8 474 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 NFU1Q9UMS0 254 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SNED1Q8TER0 1413 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 POTEMA6NI47 508 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 EDIL3O43854 480 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 NOL4O94818 638 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ERLIN2O94905 339 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 LIG3P49916 1009 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SMIM5Q71RC9 77 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 KCNK18Q7Z418 384 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 IQCKQ8N0W5 287 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 DDX12PQ92771 950 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 NLRP3Q96P20 1036 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SAMM50Q9Y512 469 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 NRAPQ86VF7 1730 aa16.48■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ESYT3A0FGR9 886 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PALMO75781 387 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 KCTD16Q68DU8 428 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 KAT2BQ92831 832 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 CEP72Q9P209 647 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ZNF233A6NK53 670 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 TDP2O95551 362 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 GUCY2DQ02846 1103 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 EYA3Q99504 573 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 TSG101Q99816 390 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 AFF2P51816 1311 aa16.47■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ESYT2A0FGR8 921 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 A6NNZ2 444 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 BAG3O95817 575 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SERPING1P05155 500 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ATP1A2P50993 1020 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PPP4CP60510 307 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PSMD2Q13200 908 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 FTCDO95954 541 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 KLRC1P26715 233 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 CDK8P49336 464 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 DNA2P51530 1060 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PAK2Q13177 524 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 NAB2Q15742 525 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 CFAP58Q5T655 872 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 PROM2Q8N271 834 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 IFT81Q8WYA0 676 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.46■□□□□ 0.23
SYP-201ENST00000263233 ZPR1O75312 459 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SMARCA1P28370 1054 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 NDUFAB1O14561 156 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 APBA1Q02410 837 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PDIA5Q14554 519 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ECM1Q16610 540 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SLC51AQ86UW1 340 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 MREGQ8N565 214 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KRT12Q99456 494 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms