RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.45■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLURP2P0DP57 97 aa24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CYP3A7P24462 503 aa24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF11P52732 1056 aa24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.45■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L11C9JVI0 530 aa24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L18D6R9N7 530 aa24.44■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L19D6RCP7 530 aa24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L20D6RJB6 530 aa24.44■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP17L24Q0WX57 530 aa24.44■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 MRIQ9BWK5 157 aa24.44■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SH2D4AQ9H788 454 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SIPA1L1O43166 1804 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM37O94972 964 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MCM3P25205 808 aa24.43■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CEP63Q96MT8 703 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC66A2RUB6 948 aa24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 E9PMD0 336 aa24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLA2G4BP0C869 781 aa24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC1A4P43007 532 aa24.42■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 NEK11Q8NG66 645 aa24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.42■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 PODNQ7Z5L7 613 aa24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DEF6Q9H4E7 631 aa24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TACC1O75410 805 aa24.41■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 TAF3Q5VWG9 929 aa24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERICH4A6NGS2 130 aa24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AKR1B10O60218 316 aa24.41■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 JADE2Q9NQC1 790 aa24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EP400Q96L91 3159 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POTEB3A0JP26 581 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POTECB2RU33 542 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRLRP16471 622 aa24.4■■□□□ 1.5
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 AP3B2Q13367 1082 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POTEBQ6S5H4 581 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IDI2Q9BXS1 227 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SNX12Q9UMY4 172 aa24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MEIS2O14770 477 aa24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF185O15231 689 aa24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PJA2O43164 708 aa24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CYP11B2P19099 503 aa24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.39■■□□□ 1.5
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