RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 MSH4O15457 936 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PDIA5Q14554 519 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SV2BQ7L1I2 683 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 OTUD5Q96G74 571 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PNMA5Q96PV4 448 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 TRIM9Q9C026 710 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 POLD4Q9HCU8 107 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ABCB11O95342 1321 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 POTEFA5A3E0 1075 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 E9PMD0 336 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 VWA5AO00534 786 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ZBED4O75132 1171 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 POTEIP0CG38 1075 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 FCER1AP12319 257 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 EPHX2P34913 555 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PRCPP42785 496 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PDE4DQ08499 809 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 POTEGQ6S5H5 508 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SARM1Q6SZW1 724 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 TMC6Q7Z403 805 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.94e-7■■■□□ 18.4
CS-215ENST00000549143 LENG9Q96B70 501 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 COL20A1Q9P218 1284 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CSADQ9Y600 493 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PIK3CDO00329 1044 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 HS1BP3Q53T59 392 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ELP3Q9H9T3 547 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 EXOC1Q9NV70 894 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 RGL1Q9NZL6 768 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 MYMKA6NI61 221 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PLA2G6O60733 806 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 MAP3K9P80192 1104 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 AMPD3Q01432 767 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 STK4Q13043 487 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 WDR18Q9BV38 432 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 RMND1Q9NWS8 449 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CENPFP49454 3210 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 IRF6O14896 467 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 MED24O75448 989 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ARP10275 920 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CYP3A7P24462 503 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.98e-8■■■□□ 18.2
CS-215ENST00000549143 CEP55Q53EZ4 464 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 IL31RAQ8NI17 732 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 NELFBQ8WX92 580 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 DDX12PQ92771 950 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 POTEJP0CG39 1038 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ERCC3P19447 782 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PSMC6P62333 389 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PAK1Q13153 545 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 COG2Q14746 738 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 EML1O00423 815 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 KLRC4O43908 158 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 GAS7O60861 476 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-215ENST00000549143 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms