RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534323.1

BBOX1-208, Transcript of gamma-butyrobetaine hydroxylase 1, human

TSL 2

Gene BBOX1, Length 457 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	ADH5	P11766	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	PCSK2	P16519	638 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	NF2	P35240	595 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	GYG1	P46976	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	VGLL4	Q14135	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBOX1-208	ENST00000534323	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	COL6A3	P12111	3177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	GRM8	O00222	908 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	VAMP4	O75379	141 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	CTGF	P29279	349 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	KCNJ4	P48050	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	MMP14	P50281	582 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	CACNB3	P54284	484 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	MOGS	Q13724	837 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	UTY	O14607	1347 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	EDN3	P14138	238 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	FUT4	P22083	530 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	CRK	P46108	304 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	CCL15	Q16663	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.5	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.5	□□□□□ -1.69
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms