RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527197.5

PUF60-209, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUF60, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-209ENST00000527197 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 GDAQ9Y2T3 454 aa16.2■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 EDIL3O43854 480 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 TM4SF4P48230 202 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 AP3B2Q13367 1082 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 STIM1Q13586 685 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 LRRC15Q8TF66 581 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 LRWD1Q9UFC0 647 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.19■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP27XA6NNY8 438 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 BMP3P12645 472 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 TNNT1P13805 278 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 JAG1P78504 1218 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 AMPD3Q01432 767 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 NR1I3Q14994 352 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 SPRYD7Q5W111 196 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ADSSL1Q8N142 457 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 AMNQ9BXJ7 453 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ANO3Q9BYT9 981 aa16.18■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PPP1R2P41236 205 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PRCPP42785 496 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 SREBF2Q12772 1141 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 GRB10Q13322 594 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PDIA5Q14554 519 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 RASA3Q14644 834 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 FBXO11Q86XK2 927 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 TRIM9Q9C026 710 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 EXOC1Q9NV70 894 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 DYNC1I1O14576 645 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PSMA7O14818 248 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 CCP110O43303 1012 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 RGS19P49795 217 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ASIC1P78348 528 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 TMX1Q9H3N1 280 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.17■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 POTEMA6NI47 508 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.187e-9■■■■□ 26.6
PUF60-209ENST00000527197 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PTPN14Q15678 1187 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 KRT79Q5XKE5 535 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 FAM83AQ86UY5 434 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PNMA5Q96PV4 448 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 GOPCQ9HD26 462 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.16■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 A0A1W2PRG0 241 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L15C9J2P7 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L11C9JVI0 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L18D6R9N7 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L22D6RA61 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L19D6RCP7 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L20D6RJB6 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 SLC26A4O43511 780 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 TBC1D12O60347 775 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PBX1P40424 430 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP11P51784 963 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L24Q0WX57 530 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 TRAF1Q13077 416 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 KRT31Q15323 416 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 PTPN21Q16825 1174 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 CEP135Q66GS9 1140 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 SV2BQ7L1I2 683 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 WNK4Q96J92 1243 aa16.15■□□□□ 0.18
PUF60-209ENST00000527197 MBOAT7Q96N66 472 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms