RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAD21	O60216	631 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	GCGR	P47871	477 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CNTN2	Q02246	1040 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MTX1	Q13505	466 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	BFSP2	Q13515	415 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CPXCR1	Q8N123	301 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	THAP11	Q96EK4	314 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CRBN	Q96SW2	442 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	TLR9	Q9NR96	1032 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CLDND1	Q9NY35	253 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	SWAP70	Q9UH65	585 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	FBXO40	Q9UH90	709 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MYO7A	Q13402	2215 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	AVPR2	P30518	371 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	LTBR	P36941	435 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZXDA	P98168	799 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	PLCB2	Q00722	1185 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CLUL1	Q15846	466 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CYP4X1	Q8N118	509 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CHST13	Q8NET6	341 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MEIS3	Q99687	375 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	AAAS	Q9NRG9	546 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	ASB14	A6NK59	587 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	STXBP3	O00186	592 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MBTPS2	O43462	519 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CYP2D6	P10635	497 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPNMB	Q14956	572 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPAIN	Q86UA6	219 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CCDC17	Q96LX7	622 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384		H3BNC9	293 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	NCK2	O43639	380 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZBED4	O75132	1171 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MYL3	P08590	195 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	NBL1	P41271	181 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	EPC2	Q52LR7	807 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	TNNI3K	Q59H18	835 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPR108	Q9NPR9	543 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	NOD1	Q9Y239	953 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	INSL6	Q9Y581	213 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	USP17L12	C9JPN9	530 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	USP17L21	D6R901	530 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	EFCAB14	O75071	495 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	KDM4A	O75164	1064 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CPT1A	P50416	773 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPM6B	Q13491	265 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	TCTN1	Q2MV58	587 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTP4A2-208	ENST00000524384	CAGE1	Q8TC20	777 aa		9.79	□□□□□ -0.84

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