RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489589.1

GDI1-213, Transcript of GDP dissociation inhibitor 1, human

TSL 2

Gene GDI1, Length 918 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GDI1-213	ENST00000489589	KLRC3	Q07444	240 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SCRN1	Q12765	414 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SEC23A	Q15436	765 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	GBF1	Q92538	1859 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	CA3	P07451	260 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TLL1	O43897	1013 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ZBED4	O75132	1171 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	DDAH1	O94760	285 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	CYP2C9	P11712	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	KIF5B	P33176	963 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	RTN1	Q16799	776 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SMPD1	P17405	629 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	STX6	O43752	255 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	NMT2	O60551	498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	GNAQ	P50148	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SNAP25	P60880	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	NKX3-2	P78367	333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GDI1-213	ENST00000489589		H3BQV1	296 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	TTLL1	O95922	423 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	SYT1	P21579	422 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	WASF1	Q92558	559 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	NID2	Q14112	1375 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	MYH8	P13535	1937 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	JAK2	O60674	1132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	IFNAR1	P17181	557 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GDI1-213	ENST00000489589	RXRA	P19793	462 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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