RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP4K2Q12851 820 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SP8Q8IXZ3 490 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PALD1Q9ULE6 856 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ARNTLO00327 626 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SGSM2O43147 1006 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PRODHO43272 600 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP2C8P10632 490 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC6A11P48066 632 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRNA2Q15822 529 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 NLRP10Q86W26 655 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 C1orf159Q96HA4 380 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 X6R8D5 127 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 DLX3O60479 287 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 DGKIO75912 1065 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 CTSWP56202 376 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 TESK1Q15569 626 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 MTERF2Q49AM1 385 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 LILRA6Q6PI73 481 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 NSMFQ6X4W1 530 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 C8orf37Q96NL8 207 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNC2Q96PR1 638 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 H7BY64 318 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 FFAR3O14843 346 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PDPK1O15530 556 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXA5P20719 270 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 STEAP3Q658P3 488 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 Q8N1Y9 231 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SYT8Q8NBV8 401 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR27Q9NS67 375 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 FGFR1P11362 822 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 NBPF4Q96M43 638 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1B0GTL3 188 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 MAFKO60675 156 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 CAPNS1P04632 268 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 C8BP07358 591 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 STAT5AP42229 794 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNC1P48547 511 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 CAP1Q01518 475 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 VWA3BQ502W6 1294 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATC1Q76KD6 591 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 DCAF4Q8WV16 495 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NOX5Q96PH1 765 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 CDC6Q99741 560 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAMTS20P59510 1910 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 BLACEA4D250 179 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 KRIT1O00522 736 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SLURP1P55000 103 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 HTRA3P83110 453 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 LIPIQ6XZB0 460 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 DPH6Q7L8W6 267 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 MIB1Q86YT6 1006 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms