RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 GPRASP2Q96D09 838 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 EPSTI1Q96J88 318 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 JADE2Q9NQC1 790 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 RMND1Q9NWS8 449 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 DACH1Q9UI36 760 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 FAM86B1E9PN63 330 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 ZBED4O75132 1171 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 TDP2O95551 362 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 FAM86B2P0C5J1 330 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 RPA1P27694 616 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 MCM7P33993 719 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 USP49Q70CQ1 688 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 SULF1Q8IWU6 871 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 RAD54LQ92698 747 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 PPME1Q9Y570 386 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.28□□□□□ -1.24
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SMC2O95347 1197 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 UBE2SQ16763 222 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 CNNM3Q8NE01 707 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO40Q9UH90 709 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 UBE4BO95155 1302 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 MSH4O15457 936 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TXLNAP40222 546 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 HOMER1Q86YM7 354 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 COL20A1Q9P218 1284 aa7.27□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SMTNL1A8MU46 457 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ADM5C9JUS6 153 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ATG7O95352 703 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A27O95847 323 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SCP2P22307 547 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SLC12A3P55017 1021 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ENPEPQ07075 957 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PGM5Q15124 567 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 CABP7Q86V35 215 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TIPINQ9BVW5 301 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PXMP2Q9NR77 195 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SOCS7O14512 581 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 AP5Z1O43299 807 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PRR29P0C7W0 189 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 GJA5P36382 358 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 MED15Q96RN5 788 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 STRA6Q9BX79 667 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 FECHP22830 423 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 NF2P35240 595 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 KCNJ6P48051 423 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF131P52739 623 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 CEP55Q53EZ4 464 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 UNC13DQ70J99 1090 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM9Q9C026 710 aa7.26□□□□□ -1.25
PRKCI-202ENST00000476635 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms