RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445003.5

SMIM25-204, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 3

Gene SMIM25, Length 539 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-204ENST00000445003 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L15C9J2P7 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L11C9JVI0 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L18D6R9N7 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L22D6RA61 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L19D6RCP7 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L20D6RJB6 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 JAG1P78504 1218 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CXCL9Q07325 125 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 RBL2Q08999 1139 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L24Q0WX57 530 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 STK4Q13043 487 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MCM6Q14566 821 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MB21D1Q8N884 522 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 POTEMA6NI47 508 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 GYPCP04921 128 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CCDC175P0C221 793 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 RPA1P27694 616 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 POLD1P28340 1107 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 GHRHRQ02643 423 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 TUBB2AQ13885 445 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 JDP2Q8WYK2 163 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 DDX12PQ92771 950 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ERO1AQ96HE7 468 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 PLIN2Q99541 437 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 COL4A5P29400 1685 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 A0A1W2PQJ5 194 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 FRMD3A2A2Y4 597 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 SLURP2P0DP57 97 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 FDX1P10109 184 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 UBXN1Q04323 297 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ANKRD7Q92527 254 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 LPAR1Q92633 364 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 LENG9Q96B70 501 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 TSG101Q99816 390 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CLRN2A0PK11 232 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 OPLAHO14841 1288 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 RAD21O60216 631 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 GNA14O95837 355 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 POLR2MP0CAP2 368 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CDK17Q00537 523 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CEP63Q96MT8 703 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 DNAJC7Q99615 494 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MTFR1LQ9H019 292 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MAF1Q9H063 256 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 VPS16Q9H269 839 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 WNT10BO00744 389 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 PLA2G4BP0C869 781 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CASP14P31944 242 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 ACER1Q8TDN7 264 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 HOOK2Q96ED9 719 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-204ENST00000445003 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms