RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433137.1

MED28P4-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MED28P4, Length 572 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P4-201ENST00000433137 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 MEIS3Q99687 375 aa8.16□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 KLHL3Q9UH77 587 aa8.16□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.16□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.16□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 BCORQ6W2J9 1755 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 CDHR2Q9BYE9 1310 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 GNAI3P08754 354 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 MMP10P09238 476 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 ACRP10323 421 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 ASPAP45381 313 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 TNNI3KQ59H18 835 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 MTFR1LQ9H019 292 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
MED28P4-201ENST00000433137 C9orf172C9J069 976 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 GLB1P16278 677 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ATP8B2P98198 1209 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ARSHQ5FYA8 562 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 TMEM87BQ96K49 555 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 TM9SF2Q99805 663 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 NYXQ9GZU5 481 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.14□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 CASZ1Q86V15 1759 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 A0A1W2PQH9 124 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 PDE8AO60658 829 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ZBTB7AO95365 584 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 GUCY2CP25092 1073 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 MTX1Q13505 466 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ADGRE1Q14246 886 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 MBTPS1Q14703 1052 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 TTC6Q86TZ1 520 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 HID1Q8IV36 788 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 FAM13CQ8NE31 585 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SUCLG2Q96I99 432 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SLC9A7Q96T83 725 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 PIDD1Q9HB75 910 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SCN7AQ01118 1682 aa8.13□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 GNAI2P04899 355 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 KCNA3P22001 575 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 PPP2R5EQ16537 467 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 CRY2Q49AN0 593 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 NACC1Q96RE7 527 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MED28P4-201ENST00000433137 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms