RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429406.1

USP9YP9-201, Transcript of USP9Y pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP9, Length 715 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP9-201ENST00000429406 CRHR2Q13324 411 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 WNK4Q96J92 1243 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 PTPN18Q99952 460 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.35□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 LAMB2P55268 1798 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 PRMT2P55345 433 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 MESP2Q0VG99 397 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP9YP9-201ENST00000429406 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 TAF1P21675 1872 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CAP1Q01518 475 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 ARID3AQ99856 593 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 MYO1BO43795 1136 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 TLR2O60603 784 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CD8BP10966 210 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 GTF2A2P52657 109 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 PRKG1Q13976 671 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 DLGAP5Q15398 846 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 LILRA6Q6PI73 481 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 DYMQ7RTS9 669 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 MXD3Q9BW11 206 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 VCANP13611 3396 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 PSME4Q14997 1843 aa6.32□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 COL4A1P02462 1669 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 SASH1O94885 1247 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 IGHA2P01877 340 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 GJA8P48165 433 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CTSWP56202 376 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 KRT24Q2M2I5 525 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CCNJLQ8IV13 435 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 NETO1Q8TDF5 533 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 TOX2Q96NM4 488 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 CD209Q9NNX6 404 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 VAV3Q9UKW4 847 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.31□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 GJB1P08034 283 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 HOXD10P28358 340 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 ASPAP45381 313 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 TNFAIP1Q13829 316 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 RASA3Q14644 834 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 KIF22Q14807 665 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.3□□□□□ -1.4
USP9YP9-201ENST00000429406 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms