RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428348.6

AC106017.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC106017.1, Length 440 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC106017.1-201ENST00000428348 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.56□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 NAPBQ9H115 298 aa13.56□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.56□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.56□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.56□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 EDNRBP24530 442 aa13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 SYDE2Q5VT97 1194 aa13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 RGS22Q8NE09 1264 aa13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 COPS5Q92905 334 aa13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 CLDND1Q9NY35 253 aa13.55□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 NFIBO00712 420 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 MMP3P08254 477 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 IRS1P35568 1242 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 PPARAQ07869 468 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 AFG1LQ8WV93 481 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 EDAQ92838 391 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 YME1L1Q96TA2 773 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 LCTP09848 1927 aa13.54□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 RB1P06400 928 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 COL19A1Q14993 1142 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 STXBP2Q15833 593 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 TMEM192Q8IY95 271 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 IWS1Q96ST2 819 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 HDAC6Q9UBN7 1215 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 MTMR7Q9Y216 660 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 RWDD3Q9Y3V2 267 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 ZNF318Q5VUA4 2279 aa13.53□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 MICAL3Q7RTP6 2002 aa13.52□□□□□ -0.24
AC106017.1-201ENST00000428348 RSPH10B2B2RC85 870 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 RSPH10BP0C881 870 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 SLC16A2P36021 539 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 PSEN2P49810 448 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 LAMC2Q13753 1193 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 CCDC62Q6P9F0 684 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 RNF135Q8IUD6 432 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 SEPT8Q92599 483 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 KAT2BQ92831 832 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 TOP1MTQ969P6 601 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 ALG1Q9BT22 464 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.52□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 STXBP3O00186 592 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 MFSD10Q14728 455 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 LY6KQ17RY6 165 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 CHST3Q7LGC8 479 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 RPAINQ86UA6 219 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 FBXO11Q86XK2 927 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa13.51□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 WDFY4Q6ZS81 3184 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 MBTPS2O43462 519 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 PPFIA4O75335 1185 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 ARIH2O95376 493 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 NOVP48745 357 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 ARHGAP1Q07960 439 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 TRIM67Q6ZTA4 783 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 FIBCD1Q8N539 461 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 APBB2Q92870 758 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 MUTYHQ9UIF7 546 aa13.5□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 TMEM221A6NGB7 291 aa13.49□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 M0R296 226 aa13.49□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 M0R2C6 588 aa13.49□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 CAND2O75155 1236 aa13.49□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
AC106017.1-201ENST00000428348 UPP2O95045 317 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms