RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CAP2P40123 477 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UNC13DQ70J99 1090 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 P2RX5Q93086 422 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCP110O43303 1012 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SREBF1P36956 1147 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PRR16Q569H4 304 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HYIQ5T013 277 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PANX2Q96RD6 677 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VCPKMTQ9H867 229 aa22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 BICDL2A1A5D9 508 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GYPCP04921 128 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CASP14P31944 242 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPP1R2P41236 205 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DDX12PQ92771 950 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MFAP3LO75121 409 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 STAT3P40763 770 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 Q4G0T1 1027 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIFC2Q96AC6 838 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAP3K10Q02779 954 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC174Q6PII3 467 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIF18AQ8NI77 898 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LENG9Q96B70 501 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM86B1E9PN63 330 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZSCAN12O43309 604 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IDEP14735 1019 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UBXN1Q04323 297 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RASA3Q14644 834 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TNIP1Q15025 636 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SH2D4AQ9H788 454 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POTEB3A0JP26 581 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POTECB2RU33 542 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PIK3CDO00329 1044 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EGFRP00533 1210 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POTEBQ6S5H4 581 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LGALS16A8MUM7 142 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 E9PMD0 336 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TBX3O15119 743 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNGA4Q8IV77 575 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MED24O75448 989 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ASNSP08243 561 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CIITAP33076 1130 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TRAF1Q13077 416 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MB21D1Q8N884 522 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TBC1D5Q92609 795 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CFBP00751 764 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TPM1P09493 284 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EHHADHQ08426 723 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTF1Q14872 753 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CENPPQ6IPU0 288 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC26A4O43511 780 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms