RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 CST9Q5W186 159 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 RNF214Q8ND24 703 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 ACAD9Q9H845 621 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 POTEMA6NI47 508 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 MARCH6O60337 910 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.265e-6■■■□□ 19
HDDC3-202ENST00000394272 PLS1Q14651 629 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 STX1AQ16623 288 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 NSMFQ6X4W1 530 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 MSH4O15457 936 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 PRR29P0C7W0 189 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 CEP55Q53EZ4 464 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 PAGE5Q96GU1 130 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 FAM20AQ96MK3 541 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 LCTP09848 1927 aa22.89■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CHST13Q8NET6 341 aa22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 A0A087WWV3 80 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PEX10O60683 326 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CNMDO75829 334 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 STAT6P42226 847 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 IL31RAQ8NI17 732 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SPATA20Q8TB22 786 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC15Q8TF66 581 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 ANO10Q9NW15 660 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 MEIS1O00470 390 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 OSBPP22059 807 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 MTRQ99707 1265 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PXMP2Q9NR77 195 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CAVIN2O95810 425 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PLCG1P19174 1290 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 GTF2A2P52657 109 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 UIMC1Q96RL1 719 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 RMDN3Q96TC7 470 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CETPP11597 493 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 AFMP43652 599 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PGM5Q15124 567 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CUEDC2Q9H467 287 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 BIN1O00499 593 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 ITGB5P18084 799 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 NLRP12P59046 1061 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 GRB10Q13322 594 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SPRYD7Q5W111 196 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 KRT79Q5XKE5 535 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CALML4Q96GE6 196 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 VAV3Q9UKW4 847 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 BCRP11274 1271 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 DPYDQ12882 1025 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SLC5A5Q92911 643 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PNMA5Q96PV4 448 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PLIN2Q99541 437 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 FBXO40Q9UH90 709 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 HYIQ5T013 277 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 SMARCE1Q969G3 411 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 CBX8Q9HC52 389 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms