RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364017.1

RNU6-598P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 598, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-598P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-598P-201ENST00000364017 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TMEM82A0PJX8 343 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 DRGXA6NNA5 263 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CAPN14A8MX76 684 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 DCDC2CA8MYV0 355 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ADAM10O14672 748 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PPEF2O14830 753 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TRIM66O15016 1216 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CDC14BO60729 498 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FKTNO75072 461 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PROP1O75360 226 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 BRD2P25440 801 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CAP2P40123 477 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 RGS3P49796 1198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ITGA1P56199 1179 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FOXL1Q12952 345 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SLC1A5Q15758 541 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CHRNA2Q15822 529 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CD300LDQ6UXZ3 194 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZPBP2Q6X784 338 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 Q6YL49 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LRRC55Q6ZSA7 311 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PTF1AQ7RTS3 328 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LCORLQ8N3X6 602 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 GPR152Q8TDT2 470 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 DENND1AQ8TEH3 1009 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SYT3Q9BQG1 590 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 HIPK2Q9H2X6 1198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 GJB4Q9NTQ9 266 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NUDT5Q9UKK9 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TCFL5Q9UL49 500 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NOTCH4Q99466 2003 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FAM20BO75063 409 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZBTB7AO95365 584 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CST3P01034 146 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 RHCEP18577 417 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 IGFBP4P22692 258 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NR4A2P43354 598 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 GRIA4P48058 902 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 VEGFCP49767 419 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LINC00205P59089 165 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NCOA4Q13772 614 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NKG7Q16617 165 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZNF626Q68DY1 528 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NR2C2APQ86WQ0 139 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 JAMLQ86YT9 394 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 CCNJLQ8IV13 435 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LINC00116Q8NCU8 138 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 KREMEN2Q8NCW0 462 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 TTC16Q8NEE8 873 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FBXO41Q8TF61 875 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 IGFBPL1Q8WX77 278 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PEX11GQ96HA9 241 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 HINFPQ9BQA5 517 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PLA2G12BQ9BX93 195 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 EGLN1Q9GZT9 426 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FBRSQ9HAH7 460 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PDLIM7Q9NR12 457 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 LATS2Q9NRM7 1088 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SEMA4GQ9NTN9 838 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ELOVL5Q9NYP7 299 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PLA2G3Q9NZ20 509 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 OAZ3Q9UMX2 235 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 KIAA1024Q9UPX6 916 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 SHISA3A0PJX4 238 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FUCA1P04066 466 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 ALPLP05186 524 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FAM90A13PP0C7W8 464 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 FAM90A24PP0C7X0 464 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-598P-201ENST00000364017 PRR35P0CG20 571 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms