RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363315.1

SNORD1C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 1C, humanhuman

BASIC

Gene SNORD1C, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD1C-201ENST00000363315 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 FAM160B2Q86V87 743 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 FBXO11Q86XK2 927 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 OGFOD1Q8N543 542 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 NEK11Q8NG66 645 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 AKT1S1Q96B36 256 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 MBOAT7Q96N66 472 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 MTRQ99707 1265 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CARD6Q9BX69 1037 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 NDST4Q9H3R1 872 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 DEF6Q9H4E7 631 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 GOPCQ9HD26 462 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 DNM3Q9UQ16 869 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 JAG2Q9Y219 1238 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 GDAQ9Y2T3 454 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 ATP8B3O60423 1300 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.66□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TTC26A0AVF1 554 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 A6NNZ2 444 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 SMIM22K7EJ46 135 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 PIK3CDO00329 1044 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 RIMBP2O15034 1052 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CETN3O15182 167 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TRIM37O94972 964 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 BMP3P12645 472 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 RPA1P27694 616 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CIITAP33076 1130 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 ABCD1P33897 745 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 VAV2P52735 878 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 ICA1Q05084 483 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 GRB10Q13322 594 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 ALCAMQ13740 583 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TNIP1Q15025 636 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CLUL1Q15846 466 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 HDXQ7Z353 690 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 VPS36Q86VN1 386 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 POTEDQ86YR6 584 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 NEK9Q8TD19 979 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 DDX12PQ92771 950 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 STAMQ92783 540 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 KIFC2Q96AC6 838 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 HOOK2Q96ED9 719 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 PANK4Q9NVE7 773 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 MTMR7Q9Y216 660 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD1C-201ENST00000363315 UBE4BO95155 1302 aa6.65□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 F5H6K3 240 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 WNT7AO00755 349 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 PDXKO00764 312 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 TBC1D12O60347 775 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 GFPT2O94808 682 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 APBA3O96018 575 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 MMP10P09238 476 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 IDEP14735 1019 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD1C-201ENST00000363315 RFX1P22670 979 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms