RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.56■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.56■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 TMX2Q9Y320 296 aa25.56■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 OPLAHO14841 1288 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 TRIM14Q14142 442 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 HYIQ5T013 277 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 FECHP22830 423 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 STAT2P52630 851 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 SYCP1Q15431 976 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD7Q92527 254 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 MAP7D2Q96T17 732 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.54■■□□□ 1.68
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SNX18-201ENST00000326277 FANCGO15287 622 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 IDEP14735 1019 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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SNX18-201ENST00000326277 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
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SNX18-201ENST00000326277 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 GOPCQ9HD26 462 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 SREBF1P36956 1147 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 CXCL9Q07325 125 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 EHHADHQ08426 723 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 A0A1W2PQC6 194 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 CCDC175P0C221 793 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 STAT3P40763 770 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX18-201ENST00000326277 B4DLN1 442 aa25.51■■□□□ 1.67
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SNX18-201ENST00000326277 E9PMD0 336 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 FAM86B1E9PN63 330 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 TBC1D12O60347 775 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 POTEBQ6S5H4 581 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 FAM83AQ86UY5 434 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 KRT9P35527 623 aa25.5■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 DNM2P50570 870 aa25.5■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 PIM2Q9P1W9 311 aa25.5■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 ERVK-24P63145 666 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 PSMD2Q13200 908 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 ERO1AQ96HE7 468 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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SNX18-201ENST00000326277 PIK3CDO00329 1044 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 TBX3O15119 743 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 MED24O75448 989 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 WNT10BO00744 389 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 SLC26A4O43511 780 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CAP2P40123 477 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 GNG11P61952 73 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 COASYQ13057 564 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 WDR24Q96S15 920 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 VCPKMTQ9H867 229 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 PLA2G4BP0C869 781 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CIITAP33076 1130 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 MIIPQ5JXC2 388 aa25.48■■□□□ 1.67
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