RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.3□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 EMSYQ7Z589 1322 aa12.3□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 TSPY2A6NKD2 308 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 LGR5O75473 907 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 GH1P01241 217 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 IRS1P35568 1242 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 FOXK2Q01167 660 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 PPARAQ07869 468 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 GPM6BQ13491 265 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 CCDC96Q2M329 555 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 TCTN1Q2MV58 587 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 EPC2Q52LR7 807 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 SLC30A10Q6XR72 485 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 SIRT2Q8IXJ6 389 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 C7orf31Q8N865 590 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 MAF1Q9H063 256 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 NAPBQ9H115 298 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 ECHDC1Q9NTX5 307 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 TECTAO75443 2155 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.29□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 ARIH2O95376 493 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 NOVP48745 357 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 RPS6P62753 249 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 DGKDQ16760 1214 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 TCEAL5Q5H9L2 206 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 SYDE2Q5VT97 1194 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 CCDC62Q6P9F0 684 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 EP400NLQ6ZTU2 488 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 PANK1Q8TE04 598 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 AFG1LQ8WV93 481 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 KAT2BQ92831 832 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 IL17RBQ9NRM6 502 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 CLDND1Q9NY35 253 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 HDAC6Q9UBN7 1215 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.28□□□□□ -0.44
USP41-201ENST00000292729 CCER2I3L3R5 266 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 M0R2C6 588 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 ARHGAP1Q07960 439 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MYOCDQ8IZQ8 938 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RGS22Q8NE09 1264 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 EDAQ92838 391 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 WDR19Q8NEZ3 1342 aa12.27□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MYO7AQ13402 2215 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 KMT2EQ8IZD2 1858 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 SLC16A2P36021 539 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 PSEN2P49810 448 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MBTPS1Q14703 1052 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RASGRP2Q7LDG7 609 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RPAINQ86UA6 219 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 FBXO11Q86XK2 927 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 TMEM192Q8IY95 271 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 PRSS33Q8NF86 280 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 GPATCH3Q96I76 525 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 YME1L1Q96TA2 773 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 LMAN2LQ9H0V9 348 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MUTYHQ9UIF7 546 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MTMR7Q9Y216 660 aa12.26□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MYH6P13533 1939 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 HAS3O00219 553 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MBTPS2O43462 519 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 NMT2O60551 498 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 F2P00734 622 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RSPH10BP0C881 870 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 LTBRP36941 435 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 MFSD10Q14728 455 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 LY6KQ17RY6 165 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RNF135Q8IUD6 432 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 TOP1MTQ969P6 601 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 PHOX2BQ99453 314 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 ALG1Q9BT22 464 aa12.25□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 RB1P06400 928 aa12.24□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 TOP1P11387 765 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 LAMC2Q13753 1193 aa12.24□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 STXBP2Q15833 593 aa12.24□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 SEPT14Q6ZU15 432 aa12.24□□□□□ -0.45
USP41-201ENST00000292729 CHST3Q7LGC8 479 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms