RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS16Q9H269 839 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTI2Q6NXR4 508 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POTEAQ6S8J7 498 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXO11Q86XK2 927 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM151AQ8WW52 585 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANO3Q9BYT9 981 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.9■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP3A7P24462 503 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UNC13DQ70J99 1090 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GMLQ99445 158 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.89■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BAG6P46379 1132 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HAS1Q92839 578 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POTEMA6NI47 508 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L15C9J2P7 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L11C9JVI0 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L18D6R9N7 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L22D6RA61 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L19D6RCP7 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L20D6RJB6 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L24Q0WX57 530 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MCM6Q14566 821 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSC1Q92574 1164 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MBOAT7Q96N66 472 aa23.88■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1W2PQC6 194 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LGALS16A8MUM7 142 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMD14O00487 310 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FECHP22830 423 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBXN1Q04323 297 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.87■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYMKA6NI61 221 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAD17O75943 681 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GYPCP04921 128 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASP14P31944 242 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK4Q13043 487 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMD2Q13200 908 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HYIQ5T013 277 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC175P0C221 793 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MMP14P50281 582 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD7Q92527 254 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOPCQ9HD26 462 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.86■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEIS2O14770 477 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DPEP1P16444 411 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JAG1P78504 1218 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MB21D1Q8N884 522 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERO1AQ96HE7 468 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK24Q9Y6E0 443 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.85■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLRN2A0PK11 232 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBX3O15119 743 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNM2P50570 870 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NIM1KQ8IY84 436 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNAI1Q9UI46 699 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.84■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FCER1AP12319 257 aa23.83■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGAP4P98171 946 aa23.83■■□□□ 1.41
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms