RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 LZTS2Q9BRK4 669 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM129AQ9BZQ8 928 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SELENONQ9NZV5 590 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 V9GYQ6 96 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KRT19P08727 400 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 AFMP43652 599 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 DRP2Q13474 957 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CASP8Q14790 479 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 AACSQ86V21 672 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 MOSPD2Q8NHP6 518 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 EXOC6Q8TAG9 804 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FAF2Q96CS3 445 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CRELD1Q96HD1 420 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 B3GALT6Q96L58 329 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RBBP8Q99708 897 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 EHD1Q9H4M9 534 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RNF14Q9UBS8 474 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KMOO15229 486 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 VNN2O95498 520 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM200BP0CF97 657 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CA4P22748 312 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GABPAQ06546 454 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM16LQ309B1 348 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 C4orf46Q504U0 113 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 NEK8Q86SG6 692 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CADPS2Q86UW7 1296 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 LGMNQ99538 433 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ST7Q9NRC1 585 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GMEB2Q9UKD1 530 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 DMTF1Q9Y222 760 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GSAPA4D1B5 854 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 POTEMA6NI47 508 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TALDO1P37837 337 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GSTM5P46439 218 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 LBRQ14739 615 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 POTEHQ6S545 545 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 POTEGQ6S5H5 508 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PARP9Q8IXQ6 854 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TTC5Q8N0Z6 440 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 VPS35Q96QK1 796 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 EPB41L5Q9HCM4 733 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL14Q9P2G3 628 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TSPAN9O75954 239 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC4A2P04920 1241 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 MPOP05164 745 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CA8P35219 290 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 MPP2Q14168 576 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GALNT3Q14435 633 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 MAPRE2Q15555 327 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ARMC3Q5W041 872 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 VSIG1Q86XK7 387 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 OGFOD1Q8N543 542 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 RDH13Q8NBN7 331 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TNMDQ9H2S6 317 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 HPS5Q9UPZ3 1129 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 UBE4BO95155 1302 aa3.41□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SPAG7O75391 227 aa3.4□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GPC4O75487 556 aa3.4□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 BAG2O95816 211 aa3.4□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 IMPDH2P12268 514 aa3.4□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KRT13P13646 458 aa3.4□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM27P14373 513 aa3.4□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms