RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 TRAF1Q13077 416 aa20.56■□□□□ 0.88
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TSNARE1-207ENST00000521825 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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TSNARE1-207ENST00000521825 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-207ENST00000521825 RMDN3Q96TC7 470 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-207ENST00000521825 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.56■□□□□ 0.88
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TSNARE1-207ENST00000521825 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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TSNARE1-207ENST00000521825 LY6KQ17RY6 165 aa20.49■□□□□ 0.87
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TSNARE1-207ENST00000521825 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 A6NJR5 290 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 ZBTB43O43298 467 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 CD4P01730 458 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 PSMC6P62333 389 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 ITGA7Q13683 1181 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-207ENST00000521825 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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