RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520580.5

SREK1-208, Transcript of splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1, human

TSL 2

Gene SREK1, Length 2,369 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREK1-208	ENST00000520580	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CKM	P06732	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ASPA	P45381	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	LRRC32	Q14392	662 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580		K7ESF4	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ARVCF	O00192	962 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CFB	P00751	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	IFNGR1	P15260	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ITIH2	P19823	946 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	DIO2	Q92813	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580		A6NNZ2	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	KCNK3	O14649	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ERC2	O15083	957 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	LRIG2	O94898	1065 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	HAL	P42357	657 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	HTR3A	P46098	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	USP14	P54578	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	RNF4	P78317	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ST5	P78524	1137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PAK1	Q13153	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	COPS5	Q92905	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580		A0A087WZG4	1122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	RBP3	P10745	1247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	SLC9A1	P19634	815 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	RAB6A	P20340	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	OCRL	Q01968	901 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TPP1	O14773	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	TGM5	O43548	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	SLITRK5	O94991	958 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PLS3	P13797	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	PHKG2	P15735	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SREK1-208	ENST00000520580	BDNF	P23560	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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