RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC120Q96HB5 630 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 EPN3Q9H201 632 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 TCFL5Q9UL49 500 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SUSD5O60279 629 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SYPP08247 313 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 TEKQ02763 1124 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 MST1RQ04912 1400 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF205O95201 554 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SERINC3Q13530 473 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 PHLPP1O60346 1717 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 H0Y8X5 98 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 VAV1P15498 845 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 BVESQ8NE79 360 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 KIF1BO60333 1816 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 POU4F1Q01851 419 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 GRB10Q13322 594 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 PPP2R5DQ14738 602 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 CBLL1Q75N03 491 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 AKT3Q9Y243 479 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 TECPR2O15040 1411 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SV2CQ496J9 727 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 MKL1Q969V6 931 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 ABCC11Q96J66 1382 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM82A0PJX8 343 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 GDNFP39905 211 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 DUSP4Q13115 394 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RGL3Q3MIN7 710 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 SHPRHQ149N8 1683 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 PIK3C2GO75747 1445 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LRP6O75581 1613 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 AGRPO00253 132 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 PDPK1O15530 556 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 FKTNO75072 461 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 AMPD2Q01433 879 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 RASGRF1Q13972 1273 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-225ENST00000515835 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms