RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 NCOA7Q8NI08 942 aa25.62■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 COPS5Q92905 334 aa25.62■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 RMDN3Q96TC7 470 aa25.62■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 MYH6P13533 1939 aa25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 CHMP4BP1P59074 171 aa25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 STXBP2Q15833 593 aa25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM240Q5SV17 173 aa25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF365Q70YC5 407 aa25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 E7EWF7 191 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 SGSM2O43147 1006 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 KPNA6O60684 536 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 CCL23P55773 120 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 WTAPQ15007 396 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 CHST3Q7LGC8 479 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 IWS1Q96ST2 819 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 IL23AQ9NPF7 189 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.6■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 HOMER1Q86YM7 354 aa25.59■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 COL20A1Q9P218 1284 aa25.59■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.59■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 ZBTB5O15062 677 aa25.58■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 FGBP02675 491 aa25.58■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.58■■□□□ 1.69
RBMS1-211ENST00000477486 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 TRAF1Q13077 416 aa25.57■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 LY6KQ17RY6 165 aa25.57■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.57■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.57■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 A6NJR5 290 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 DLL1O00548 723 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 ARIH2O95376 493 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 GH1P01241 217 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 DNAJB2P25686 324 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 GRM4Q14833 912 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 MAP4K1Q92918 833 aa25.56■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 NR3C2P08235 984 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 CYP2C9P11712 490 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 AFG1LQ8WV93 481 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 MYLIPQ8WY64 445 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 PIGSQ96S52 555 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 SENP2Q9HC62 589 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 NOD1Q9Y239 953 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.55■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.54■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.54■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.54■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.54■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 TIFAQ96CG3 184 aa25.54■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 PXMP2Q9NR77 195 aa25.54■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 HSD17B4P51659 736 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 CASC1Q6TDU7 716 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 HERVK_113Q902F9 699 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 MTMR8Q96EF0 704 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 SCLYQ96I15 445 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.53■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 FOSL2P15408 326 aa25.52■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 RETREG2Q8NC44 543 aa25.52■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.52■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF576Q9H609 170 aa25.52■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.52■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 MSRAQ9UJ68 235 aa25.52■■□□□ 1.68
RBMS1-211ENST00000477486 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 POLR2MP0CAP2 368 aa25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 ZBBXA8MT70 800 aa25.5■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 OPLAHO14841 1288 aa25.5■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 MMP3P08254 477 aa25.5■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 PBX2P40425 430 aa25.5■■□□□ 1.67
RBMS1-211ENST00000477486 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms