RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	POTEM	A6NI47	508 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	HIP1	O00291	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PFDN1	O60925	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CYP21A2	P08686	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GSTA2	P09210	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CALB2	P22676	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KRT9	P35527	623 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP11A	P98196	1134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BNIP1	Q12981	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FLII	Q13045	1269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LSAMP	Q13449	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BIRC3	Q13489	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	POSTN	Q15063	836 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	P3H1	Q32P28	736 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	VCX	Q9H320	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147		E7ENQ6	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	KRT86	O43790	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	HIP1R	O75146	1068 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	PPP6R2	O75170	966 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	SHBG	P04278	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	PRLR	P16471	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	HSD17B3	P37058	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	RAD23B	P54727	409 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CARD9	Q9H257	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF1B	O60333	1816 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	TET3	O43151	1660 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	PRC1	O43663	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	CEP104	O60308	925 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	PEX11A	O75192	247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	SUPT3H	O75486	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBMS1-208	ENST00000474147	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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