RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MYH1P12882 1939 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PSMD14O00487 310 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SKILP12757 684 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PPP1R2P41236 205 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MAP3K9P80192 1104 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MYL5Q02045 173 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ZNF174Q15697 407 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 DACT2Q5SW24 774 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 DPP9Q86TI2 863 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 OXER1Q8TDS5 423 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CUEDC2Q9H467 287 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 USP17L10C9JJH3 530 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PRPHP41219 470 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 LPAR1Q92633 364 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SLFN14P0C7P3 912 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 POTEJP0CG39 1038 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 NOVP48745 357 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 GABPAQ06546 454 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SPA17Q15506 151 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 KIFC2Q96AC6 838 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 NYAP2Q9P242 653 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 BACH1O14867 736 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MAP2K2P36507 400 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SNAPC2Q13487 334 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CERS5Q8N5B7 392 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 BANK1Q8NDB2 785 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CLIC6Q96NY7 704 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CSRNP2Q9H175 543 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 FEM1BQ9UK73 627 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SMCO2A6NFE2 343 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 M0QZ92 97 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MCM7P33993 719 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 STAT2P52630 851 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SNED1Q8TER0 1413 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 STXBP3O00186 592 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 HSF2BPO75031 334 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CTAGE8P0CG41 777 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CETPP11597 493 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PTGDRQ13258 359 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 IQCB1Q15051 598 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 HACE1Q8IYU2 909 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TNFRSF25Q93038 417 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 GSDMAQ96QA5 445 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 DNM2P50570 870 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 GNG11P61952 73 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TKFCQ3LXA3 575 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 HDXQ7Z353 690 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 NEK8Q86SG6 692 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 FAM83AQ86UY5 434 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TMEM232C9JQI7 657 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SLC26A4O43511 780 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PDE4DQ08499 809 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 RASA3Q14644 834 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MB21D1Q8N884 522 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 DHX58Q96C10 678 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 GGA3Q9NZ52 723 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.5□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 USP17L15C9J2P7 530 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms