RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC93	Q567U6	631 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	POTED	Q86YR6	584 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	MB21D1	Q8N884	522 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	STAM	Q92783	540 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM20A	Q96MK3	541 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	MED15	Q96RN5	788 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	GOPC	Q9HD26	462 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP8B1	O43520	1251 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	MUT	P22033	750 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CASP14	P31944	242 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CDK17	Q00537	523 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CENPP	Q6IPU0	288 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO11	Q86XK2	927 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	OGFOD1	Q8N543	542 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP112	Q8N8E3	955 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	COA7	Q96BR5	231 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	MBOAT7	Q96N66	472 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMD1	Q99460	953 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS16	Q9H269	839 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	GINM1	Q9NU53	330 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	GDA	Q9Y2T3	454 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX33	O43247	280 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PLA2G6	O60733	806 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	GYPC	P04921	128 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT9	P35527	623 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM193A	P78312	1265 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBED6	P86452	979 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP63	Q96MT8	703 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC7	Q99615	494 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CTAGE9	A4FU28	777 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	USP17L10	C9JJH3	530 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PIK3CD	O00329	1044 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PPIP5K2	O43314	1243 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	BMP3	P12645	472 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CASP1	P29466	404 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	GRB10	Q13322	594 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MAN2A1	Q16706	1144 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758		Q4G0T1	1027 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM160B2	Q86V87	743 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ANO3	Q9BYT9	981 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PP2D1	A8MPX8	630 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758		F5H6K3	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT86	O43790	486 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D12	O60347	775 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MCM3	P25205	808 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC25A	P30304	524 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K9	P80192	1104 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KLRC3	Q07444	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KCTD1	Q719H9	257 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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