RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 GNAI3P08754 354 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ACRP10323 421 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ALADP13716 330 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SMPD1P17405 629 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CYP7A1P22680 504 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 GNASQ5JWF2 1037 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TBX21Q9UL17 535 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.52□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CABYRO75952 493 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ACTN1P12814 892 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 JAG1P78504 1218 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TFF2Q03403 129 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ACER1Q8TDN7 264 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ZNF384Q8TF68 577 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 KCNH6Q9H252 994 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 HIPK3Q9H422 1215 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 DNAJC18Q9H819 358 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.51□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PRR33A8MZF0 331 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 IGHA2P01877 340 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PFKMP08237 780 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 STAT3P40763 770 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 MRE11P49959 708 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 KCNQ1P51787 676 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 RASIP1Q5U651 963 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CYP4X1Q8N118 509 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SNX27Q96L92 541 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.5□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SFI1A8K8P3 1242 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PGK2P07205 417 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ASGR1P07306 291 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CYP2C18P33260 490 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 MCAMP43121 646 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PDE4CQ08493 712 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SEPT2Q15019 361 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PI16Q6UXB8 463 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ITPKCQ96DU7 683 aa9.49□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 E9PSI1 815 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ADAMTS4O75173 837 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CDK7P50613 346 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ATG4CQ96DT6 458 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SWAP70Q9UH65 585 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 FAM50BQ9Y247 325 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.48□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 TIMP2P16035 220 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 RABGGTBP53611 331 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SEC13P55735 322 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 CBLBQ13191 982 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ACVR2BQ13705 512 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.47□□□□□ -0.89
CASP4-201ENST00000393150 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms