RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN5P54829 565 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 COL19A1Q14993 1142 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 NR1I3Q14994 352 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 POSTNQ15063 836 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SYNE4Q8N205 404 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CNBD1Q8NA66 436 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 STK32BQ9NY57 414 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 USP3Q9Y6I4 520 aa8.07□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SHTN1A0MZ66 631 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 PRC1O43663 620 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CLSTN1O94985 981 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 BMP15O95972 392 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 INHAP05111 366 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK-9P63128 1117 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 NFIXQ14938 502 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 MCTP2Q6DN12 878 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 VPS37DQ86XT2 251 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 DPF2Q92785 391 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM87BQ96K49 555 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 EP400Q96L91 3159 aa8.06□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 EBAG9O00559 213 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 FANCGO15287 622 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TM4SF1P30408 202 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 PNOCQ13519 176 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 MORC3Q14149 939 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 PTPAQ15257 358 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC24Q50LG9 513 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 METTL24Q5JXM2 366 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA1Q5VX52 437 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SHC4Q6S5L8 630 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ALG1Q9BT22 464 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ABCB6Q9NP58 842 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 STIM2Q9P246 746 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087WWV3 80 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF213O14771 459 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SORBS3O60504 671 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 MFAP3LO75121 409 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINB2P05120 415 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SKOR1P84550 965 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SLC15A2Q16348 729 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF827Q17R98 1081 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.126e-7■■■■□ 25.2
CTPS1-201ENST00000372616 MYO6Q9UM54 1294 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 MAST3O60307 1309 aa8.05□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM232C9JQI7 657 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 GOLIM4O00461 696 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 BACH1O14867 736 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 OPA1O60313 960 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ERLIN2O94905 339 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 PDE8BO95263 885 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 PSMD2Q13200 908 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC31Q6UY01 552 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-201ENST00000372616 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.04□□□□□ -1.12
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