RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 DGKDQ16760 1214 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TTC30AQ86WT1 665 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TTC14Q96N46 770 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF577Q9BSK1 485 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CPA1P15085 419 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SMTNP53814 917 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 STRN3Q13033 797 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 QRICH1Q2TAL8 776 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TKFCQ3LXA3 575 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT8Q92599 483 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PHKBQ93100 1093 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MRIQ9BWK5 157 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PFASO15067 1338 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TLL1O43897 1013 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RBM25P49756 843 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4A11Q02928 519 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PTH1RQ03431 593 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PPFIA1Q13136 1202 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SYCP1Q15431 976 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TLK2Q86UE8 772 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 DGKHQ86XP1 1220 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CEP57Q86XR8 500 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FANCBQ8NB91 859 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TEKT3Q9BXF9 490 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PORCNQ9H237 461 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 E7EWF7 191 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ACRP10323 421 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2C9P11712 490 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 YARSP54577 528 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 KRT17Q04695 432 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 IER5Q5VY09 327 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L6PQ6QN14 398 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CYFIP1Q7L576 1253 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TMC7Q7Z402 723 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ARNTL2Q8WYA1 636 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 HIPK3Q9H422 1215 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 VPS54Q9P1Q0 977 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FAM50BQ9Y247 325 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 GSG1L2A8MUP6 293 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PRELPP51888 382 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TPM4P67936 248 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2SQ16763 222 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ARMCX2Q7L311 632 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 AFG1LQ8WV93 481 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CEP170P1Q96L14 293 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 DSCC1Q9BVC3 393 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 IL25Q9H293 177 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MMRN2Q9H8L6 949 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 117.2
PTPRC-201ENST00000348564 AAASQ9NRG9 546 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TMX2Q9Y320 296 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF831Q5JPB2 1677 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PTPREP23469 700 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MCM2P49736 904 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR1Q13613 665 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 DRC7Q8IY82 874 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR14Q8NCE2 650 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM169Q96HH4 297 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 GABRQQ9UN88 632 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ABCB11O95342 1321 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SGPL1O95470 568 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 STAG3L1P0CL83 205 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms