RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 RPS6KA3P51812 740 aa21.61■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.61■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.61■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.61■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.61■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 RAD51CO43502 376 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 LINGO3P0C6S8 592 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 TMEM94Q12767 1356 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 UPP2O95045 317 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 PTGDRQ13258 359 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 MDM1Q8TC05 714 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 LPIN2Q92539 896 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 TRIM47Q96LD4 638 aa21.6■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 ERICH2A1L162 156 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 IL17AQ16552 155 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 ERVK-9P63128 1117 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 BIRC3Q13489 604 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 ITFG2Q969R8 447 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 RMND1Q9NWS8 449 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.59■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 EPHB6O15197 1021 aa21.58■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 ABL2P42684 1182 aa21.58■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 TRAF1Q13077 416 aa21.58■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 TTI2Q6NXR4 508 aa21.58■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.58■■□□□ 1.05
GFI1-201ENST00000294702 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 LCA5LO95447 670 aa21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 MAGEA1P43355 309 aa21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 BLMHQ13867 455 aa21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.58■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 A6NHS1 94 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 MYBP10242 640 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 RASSF7Q02833 373 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 MIIPQ5JXC2 388 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 PRDM1O75626 825 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 ADD2P35612 726 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 TMC4Q7Z404 712 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.57■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 A0A1W2PQJ5 194 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 AKR1B10O60218 316 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 ALADP13716 330 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 FLT3P36888 993 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 RNF14Q9UBS8 474 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 CAND2O75155 1236 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 KCNJ2P63252 427 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 ISCUQ9H1K1 167 aa21.56■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 PJA2O43164 708 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 GSTA1P08263 222 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 SLMAPQ14BN4 828 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 CNKSR1Q969H4 720 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 NID2Q14112 1375 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 FTCDO95954 541 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 FESP07332 822 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.55■■□□□ 1.04
GFI1-201ENST00000294702 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms