RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 FSIP1Q8NA03 581 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 ZNF521Q96K83 1311 aa8.59□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 HOXC6P09630 235 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 GYS1P13807 737 aa8.59□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.59□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 APOL6Q9BWW8 343 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 TRIM7Q9C029 511 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 PSAPP07602 524 aa8.59□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 XKR9Q5GH70 373 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 BRF1Q92994 677 aa8.59□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 SV2BQ7L1I2 683 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.59□□□□□ -1.03
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USP3-201ENST00000268049 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 SNX25Q9H3E2 840 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-201ENST00000268049 KPNA6O60684 536 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 TBC1D8O95759 1140 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 ZNF18P17022 549 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 PRMT2P55345 433 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 VCX3BQ9H321 246 aa8.58□□□□□ -1.04
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USP3-201ENST00000268049 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 BIN1O00499 593 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 PSMA7O14818 248 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 PPFIA3O75145 1194 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 ZBTB16Q05516 673 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.58□□□□□ -1.04
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USP3-201ENST00000268049 PHKBQ93100 1093 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 RNF208Q9H0X6 261 aa8.58□□□□□ -1.04
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USP3-201ENST00000268049 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 MAP3K13O43283 966 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 TRPA1O75762 1119 aa8.58□□□□□ -1.04
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USP3-201ENST00000268049 PDE6AP16499 860 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 SYT1P21579 422 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 SLC8A1P32418 973 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 TSPY1Q01534 308 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 PRDM1O75626 825 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 CHMLP26374 656 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 GPSM2P81274 684 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 POSTNQ15063 836 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP3-201ENST00000268049 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP3-201ENST00000268049 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 DYRK4Q9NR20 520 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 MOCS3O95396 460 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-201ENST00000268049 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.57□□□□□ -1.04
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