RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	NBR1	Q14596	966 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	METRN	Q9UJH8	293 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	E2F4	Q16254	413 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	SEC24B	O95487	1268 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	CAMK2B	Q13554	666 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATRX-223	ENST00000637175	KIF3C	O14782	793 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175		G3V3G9	751 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	FOXK1	P85037	733 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	DSG2	Q14126	1118 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	C2orf72	A6NCS6	295 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	TMC2	Q8TDI7	906 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATRX-223	ENST00000637175	PLPP6	Q8IY26	295 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATRX-223	ENST00000637175	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATRX-223	ENST00000637175	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATRX-223	ENST00000637175	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATRX-223	ENST00000637175	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATRX-223	ENST00000637175	SEMA3E	O15041	775 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	POTEJ	P0CG39	1038 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	PDIA6	Q15084	440 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	7.2	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	POTEB2	H3BUK9	544 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	DPYSL4	O14531	572 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	OXER1	Q8TDS5	423 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	SLC34A2	O95436	690 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ATRX-223	ENST00000637175	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	7.13	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	MAP3K9	P80192	1104 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	PTGER2	P43116	358 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ATRX-223	ENST00000637175	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D12	O60347	775 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	EVI5	O60447	810 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	OSBP	P22059	807 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	GPR37	O15354	613 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	DOK7	Q18PE1	504 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	ZMYND10	O75800	440 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	OTUD5	Q96G74	571 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ATRX-223	ENST00000637175	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	GPR153	Q6NV75	609 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	DDX12P	Q92771	950 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	PHF14	O94880	888 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		7	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	RIMBP2	O15034	1052 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	ARSI	Q5FYB1	569 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	LHX8	Q68G74	356 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	6.99	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	JPH4	Q96JJ6	628 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	EPAS1	Q99814	870 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	NUDT7	P0C024	238 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	SNPH	O15079	494 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	FOSB	P53539	338 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATRX-223	ENST00000637175	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	FBXW7	Q969H0	707 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	NUTM2F	A1L443	756 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	FCHSD2	O94868	740 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	PTGDR	Q13258	359 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	HIC1	Q14526	733 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	LHX6	Q9UPM6	363 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	GNPAT	O15228	680 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	MAP3K7	O43318	606 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	MAP2K5	Q13163	448 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	AK7	Q96M32	723 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATRX-223	ENST00000637175	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3

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