RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GTPBP3-215	ENST00000596941	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GTPBP3-215	ENST00000596941	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GTPBP3-215	ENST00000596941	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.26	■■■□□ 2.12
GTPBP3-215	ENST00000596941	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.26	■■■□□ 2.12
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GTPBP3-215	ENST00000596941	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GTPBP3-215	ENST00000596941	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GTPBP3-215	ENST00000596941	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GTPBP3-215	ENST00000596941	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GTPBP3-215	ENST00000596941	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GTPBP3-215	ENST00000596941	ABCC1	P33527	1531 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GTPBP3-215	ENST00000596941	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GTPBP3-215	ENST00000596941	KDM5C	P41229	1560 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GTPBP3-215	ENST00000596941	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GTPBP3-215	ENST00000596941	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GTPBP3-215	ENST00000596941	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GTPBP3-215	ENST00000596941	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	PTPRM	P28827	1452 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	ATP10A	O60312	1499 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GTPBP3-215	ENST00000596941	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GTPBP3-215	ENST00000596941	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28	■■■□□ 2.07
GTPBP3-215	ENST00000596941	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GTPBP3-215	ENST00000596941	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GTPBP3-215	ENST00000596941	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GTPBP3-215	ENST00000596941	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GTPBP3-215	ENST00000596941	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GTPBP3-215	ENST00000596941	MLEC	Q14165	292 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GTPBP3-215	ENST00000596941	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GTPBP3-215	ENST00000596941	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GTPBP3-215	ENST00000596941	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GTPBP3-215	ENST00000596941	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GTPBP3-215	ENST00000596941	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
GTPBP3-215	ENST00000596941	AGL	P35573	1532 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GTPBP3-215	ENST00000596941	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.86	■■■□□ 2.05
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
GTPBP3-215	ENST00000596941	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GTPBP3-215	ENST00000596941	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GTPBP3-215	ENST00000596941	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GTPBP3-215	ENST00000596941	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GTPBP3-215	ENST00000596941	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GTPBP3-215	ENST00000596941	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
GTPBP3-215	ENST00000596941	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GTPBP3-215	ENST00000596941	C3	P01024	1663 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GTPBP3-215	ENST00000596941	A2M	P01023	1474 aa		27.7	■■■□□ 2.03
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.7	■■■□□ 2.03
GTPBP3-215	ENST00000596941	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GTPBP3-215	ENST00000596941	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GTPBP3-215	ENST00000596941	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GTPBP3-215	ENST00000596941	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GTPBP3-215	ENST00000596941	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
GTPBP3-215	ENST00000596941	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
GTPBP3-215	ENST00000596941	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GTPBP3-215	ENST00000596941	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GTPBP3-215	ENST00000596941	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.58	■■■□□ 2
GTPBP3-215	ENST00000596941	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.57	■■■□□ 2
GTPBP3-215	ENST00000596941	HSPA2	P54652	639 aa		27.55	■■■□□ 2
GTPBP3-215	ENST00000596941	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.55	■■■□□ 2
GTPBP3-215	ENST00000596941	APLP2	Q06481	763 aa		27.54	■■■□□ 2
GTPBP3-215	ENST00000596941	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.54	■■■□□ 2
GTPBP3-215	ENST00000596941	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
GTPBP3-215	ENST00000596941	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
GTPBP3-215	ENST00000596941	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GTPBP3-215	ENST00000596941	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GTPBP3-215	ENST00000596941	GGT6	Q6P531	493 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GTPBP3-215	ENST00000596941	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	STRC	Q7RTU9	1775 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	NPAT	Q14207	1427 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.4	■■□□□ 1.98

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