RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576295.5

AKAP1-217, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP1, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-217ENST00000576295 CEP162Q5TB80 1403 aa23.35■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.35■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.35■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.34■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.33■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.33■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.33■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.33■■□□□ 1.33
AKAP1-217ENST00000576295 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.31■■□□□ 1.32
AKAP1-217ENST00000576295 MADDQ8WXG6 1647 aa23.3■■□□□ 1.32
AKAP1-217ENST00000576295 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.27■■□□□ 1.32
AKAP1-217ENST00000576295 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.27■■□□□ 1.32
AKAP1-217ENST00000576295 ABCC1P33527 1531 aa23.25■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.25■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.23■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 KDM5CP41229 1560 aa23.23■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.21■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.21■■□□□ 1.31
AKAP1-217ENST00000576295 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.19■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.19■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 PTPRMP28827 1452 aa23.19■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 ABCA6Q8N139 1617 aa23.18■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.17■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.17■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.16■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.15■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 AFAP1Q8N556 730 aa23.15■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.15■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.14■■□□□ 1.3
AKAP1-217ENST00000576295 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.14■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 TIAM1Q13009 1591 aa23.13■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 ATP10AO60312 1499 aa23.12■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.11■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 MLECQ14165 292 aa23.1■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.1■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.08■■□□□ 1.29
AKAP1-217ENST00000576295 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.07■■□□□ 1.28
AKAP1-217ENST00000576295 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.06■■□□□ 1.28
AKAP1-217ENST00000576295 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
AKAP1-217ENST00000576295 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.06■■□□□ 1.28
AKAP1-217ENST00000576295 REREQ9P2R6 1566 aa23.04■■□□□ 1.28
AKAP1-217ENST00000576295 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
AKAP1-217ENST00000576295 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
AKAP1-217ENST00000576295 NCOA2Q15596 1464 aa23■■□□□ 1.27
AKAP1-217ENST00000576295 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
AKAP1-217ENST00000576295 ATP7AQ04656 1500 aa22.98■■□□□ 1.27
AKAP1-217ENST00000576295 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.98■■□□□ 1.27
AKAP1-217ENST00000576295 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.96■■□□□ 1.27
AKAP1-217ENST00000576295 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.95■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 AGLP35573 1532 aa22.93■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.92■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 C3P01024 1663 aa22.9■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 PLXNC1O60486 1568 aa22.89■■□□□ 1.26
AKAP1-217ENST00000576295 MBD5Q9P267 1494 aa22.89■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.89■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.88■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 MAP3K1Q13233 1512 aa22.86■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 A2MP01023 1474 aa22.84■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.83■■□□□ 1.25
AKAP1-217ENST00000576295 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
AKAP1-217ENST00000576295 HSPA2P54652 639 aa22.82■■□□□ 1.24
AKAP1-217ENST00000576295 MROH2AA6NES4 1674 aa22.8■■□□□ 1.24
AKAP1-217ENST00000576295 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.79■■□□□ 1.24
AKAP1-217ENST00000576295 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
AKAP1-217ENST00000576295 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.74■■□□□ 1.23
AKAP1-217ENST00000576295 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.74■■□□□ 1.23
AKAP1-217ENST00000576295 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.74■■□□□ 1.23
AKAP1-217ENST00000576295 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
AKAP1-217ENST00000576295 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.7■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.69■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 GGT6Q6P531 493 aa22.69■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.68■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.68■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 APLP2Q06481 763 aa22.68■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 STRCQ7RTU9 1775 aa22.67■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 MIA2Q96PC5 1412 aa22.66■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.65■■□□□ 1.22
AKAP1-217ENST00000576295 ZMYM3Q14202 1370 aa22.63■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.62■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 NPATQ14207 1427 aa22.6■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 KIF3BO15066 747 aa22.6■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 TSPY4P0CV99 314 aa22.6■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 TSPY10P0CW01 314 aa22.6■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.59■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.58■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
AKAP1-217ENST00000576295 PTPRKQ15262 1439 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms