RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.1□□□□□ -0.79
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R37O75864 691 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 KIF3CO14782 793 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 EMP3P54852 163 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 C2orf72A6NCS6 295 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 TMC2Q8TDI7 906 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 MARVELD3Q96A59 401 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.03□□□□□ -0.8
RRN3-204ENST00000561685 FAM205CA6NFA0 338 aa9.97□□□□□ -0.81
RRN3-204ENST00000561685 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RRN3-204ENST00000561685 GPR153Q6NV75 609 aa9.97□□□□□ -0.81
RRN3-204ENST00000561685 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RRN3-204ENST00000561685 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.96□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 SLC34A2O95436 690 aa9.95□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 FOXK1P85037 733 aa9.95□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.95□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 ERBB3P21860 1342 aa9.94□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 ARSIQ5FYB1 569 aa9.91□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RRN3-204ENST00000561685 POTEB3A0JP26 581 aa9.89□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 POTEBQ6S5H4 581 aa9.89□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 PLPP6Q8IY26 295 aa9.89□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.89□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 DSG2Q14126 1118 aa9.88□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.88□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 PDE4AP27815 886 aa9.87□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RRN3-204ENST00000561685 NUDT7P0C024 238 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.83□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.82□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 TBC1D12O60347 775 aa9.82□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.79□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 MFSD10Q14728 455 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 LHX6Q9UPM6 363 aa9.78□□□□□ -0.84
RRN3-204ENST00000561685 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-204ENST00000561685 OXER1Q8TDS5 423 aa9.76□□□□□ -0.85
RRN3-204ENST00000561685 PBX2P40425 430 aa9.74□□□□□ -0.85
RRN3-204ENST00000561685 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.73□□□□□ -0.85
RRN3-204ENST00000561685 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
RRN3-204ENST00000561685 MMRN1Q13201 1228 aa9.72□□□□□ -0.85
RRN3-204ENST00000561685 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RRN3-204ENST00000561685 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-204ENST00000561685 CFAP44Q96MT7 982 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-204ENST00000561685 PTGER2P43116 358 aa9.67□□□□□ -0.86
RRN3-204ENST00000561685 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
RRN3-204ENST00000561685 MAP3K9P80192 1104 aa9.65□□□□□ -0.86
RRN3-204ENST00000561685 ARHGAP33O14559 1287 aa9.64□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 EVI5O60447 810 aa9.64□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 CAMK2BQ13554 666 aa9.64□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.63□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.63□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.62□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 KCNH8Q96L42 1107 aa9.62□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.61□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.61□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 FOSBP53539 338 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 JPH4Q96JJ6 628 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3-204ENST00000561685 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.58□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 TK2O00142 265 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 WDR70Q9NW82 654 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 PSEN2P49810 448 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 KCNK17Q96T54 332 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 DPYSL4O14531 572 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 PTPREP23469 700 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 E2F4Q16254 413 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3-204ENST00000561685 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 PHF14O94880 888 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 FBXW7Q969H0 707 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 PDIA6Q15084 440 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 EPAS1Q99814 870 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 HRO43593 1189 aa9.48□□□□□ -0.89
RRN3-204ENST00000561685 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.46□□□□□ -0.9
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.45□□□□□ -0.9
RRN3-204ENST00000561685 STAC3Q96MF2 364 aa9.45□□□□□ -0.9
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