RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561300.1

TMOD2-205, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD2, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-205ENST00000561300 MFRPQ9BY79 579 aa10.55□□□□□ -0.72
TMOD2-205ENST00000561300 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.55□□□□□ -0.72
TMOD2-205ENST00000561300 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TMOD2-205ENST00000561300 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.54□□□□□ -0.72
TMOD2-205ENST00000561300 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.53□□□□□ -0.72
TMOD2-205ENST00000561300 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.52□□□□□ -0.73
TMOD2-205ENST00000561300 G3V3G9 751 aa10.5□□□□□ -0.73
TMOD2-205ENST00000561300 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.47□□□□□ -0.73
TMOD2-205ENST00000561300 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.45□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 ERBB3P21860 1342 aa10.43□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 PPP1R37O75864 691 aa10.42□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 DOK7Q18PE1 504 aa10.42□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD2-205ENST00000561300 MICALL2Q8IY33 904 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD2-205ENST00000561300 RIMBP2O15034 1052 aa10.37□□□□□ -0.75
TMOD2-205ENST00000561300 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD2-205ENST00000561300 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TMOD2-205ENST00000561300 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TMOD2-205ENST00000561300 CFAP44Q96MT7 982 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD2-205ENST00000561300 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.27□□□□□ -0.77
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.27□□□□□ -0.77
TMOD2-205ENST00000561300 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.26□□□□□ -0.77
TMOD2-205ENST00000561300 PTGER2P43116 358 aa10.24□□□□□ -0.77
TMOD2-205ENST00000561300 TMC2Q8TDI7 906 aa10.21□□□□□ -0.77
TMOD2-205ENST00000561300 C2orf72A6NCS6 295 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 PLCB2Q00722 1185 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 KIF3CO14782 793 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 GPR153Q6NV75 609 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.15□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 PDE4AP27815 886 aa10.15□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.15□□□□□ -0.78
TMOD2-205ENST00000561300 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.14□□□□□ -0.79
TMOD2-205ENST00000561300 ARSIQ5FYB1 569 aa10.13□□□□□ -0.79
TMOD2-205ENST00000561300 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TMOD2-205ENST00000561300 FOXK1P85037 733 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD2-205ENST00000561300 DSG2Q14126 1118 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD2-205ENST00000561300 PLPP6Q8IY26 295 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
TMOD2-205ENST00000561300 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
TMOD2-205ENST00000561300 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD2-205ENST00000561300 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD2-205ENST00000561300 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD2-205ENST00000561300 MFSD10Q14728 455 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD2-205ENST00000561300 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
TMOD2-205ENST00000561300 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.02□□□□□ -0.81
TMOD2-205ENST00000561300 SLC34A2O95436 690 aa10□□□□□ -0.81
TMOD2-205ENST00000561300 PBX2P40425 430 aa10□□□□□ -0.81
TMOD2-205ENST00000561300 WDR70Q9NW82 654 aa10□□□□□ -0.81
TMOD2-205ENST00000561300 HCSTQ9UBK5 93 aa9.98□□□□□ -0.81
TMOD2-205ENST00000561300 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.97□□□□□ -0.81
TMOD2-205ENST00000561300 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 NUDT7P0C024 238 aa9.95□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 OXER1Q8TDS5 423 aa9.95□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 CAMK2BQ13554 666 aa9.94□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.94□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.94□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 TBC1D12O60347 775 aa9.93□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 E2F4Q16254 413 aa9.92□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 LHX6Q9UPM6 363 aa9.92□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.9□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.9□□□□□ -0.82
TMOD2-205ENST00000561300 MAP3K9P80192 1104 aa9.89□□□□□ -0.83
TMOD2-205ENST00000561300 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.89□□□□□ -0.83
TMOD2-205ENST00000561300 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD2-205ENST00000561300 DPYSL4O14531 572 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD2-205ENST00000561300 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD2-205ENST00000561300 ARHGAP33O14559 1287 aa9.85□□□□□ -0.83
TMOD2-205ENST00000561300 EVI5O60447 810 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD2-205ENST00000561300 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.83□□□□□ -0.84
TMOD2-205ENST00000561300 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TMOD2-205ENST00000561300 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TMOD2-205ENST00000561300 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TMOD2-205ENST00000561300 TK2O00142 265 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD2-205ENST00000561300 P3H3Q8IVL6 736 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD2-205ENST00000561300 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TMOD2-205ENST00000561300 PDIA6Q15084 440 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 STAC3Q96MF2 364 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 HRO43593 1189 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 PSEN2P49810 448 aa9.74□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.74□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.74□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 FOSBP53539 338 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 SLC24A1O60721 1099 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 DDX12PQ92771 950 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 JPH4Q96JJ6 628 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD2-205ENST00000561300 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms