RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEIP0CG38 1075 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLCG2P16885 1265 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEFA5A3E0 1075 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 KIF3CO14782 793 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 DSG2Q14126 1118 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 FOXK1P85037 733 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC39A7Q92504 469 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 SEMA3EO15041 775 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 C2orf72A6NCS6 295 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 C7P10643 843 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMC2Q8TDI7 906 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 SEC24BO95487 1268 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 METRNQ9UJH8 293 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-677P-201ENST00000516914 G3V3G9 751 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLPP6Q8IY26 295 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-677P-201ENST00000516914 DPYSL4O14531 572 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-677P-201ENST00000516914 PDIA6Q15084 440 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-677P-201ENST00000516914 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-677P-201ENST00000516914 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-677P-201ENST00000516914 OXER1Q8TDS5 423 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-677P-201ENST00000516914 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-677P-201ENST00000516914 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-677P-201ENST00000516914 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-677P-201ENST00000516914 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZMYND10O75800 440 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC34A2O95436 690 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEJP0CG39 1038 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP3K9P80192 1104 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPR37O15354 613 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 PTGER2P43116 358 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEB2H3BUK9 544 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 EVI5O60447 810 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 BARGINQ6ZT62 677 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 OSBPP22059 807 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-677P-201ENST00000516914 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 TBC1D12O60347 775 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 DDX12PQ92771 950 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUTM2FA1L443 756 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 PHF14O94880 888 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 AK7Q96M32 723 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 DOK7Q18PE1 504 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 JPH4Q96JJ6 628 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 EPAS1Q99814 870 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 FCHSD2O94868 740 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 PTGDRQ13258 359 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 HIC1Q14526 733 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRIM66O15016 1216 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 GNPATO15228 680 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 FOSBP53539 338 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP2K5Q13163 448 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 NEUROD2Q15784 382 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPR153Q6NV75 609 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 FECHP22830 423 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUDT7P0C024 238 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARSIQ5FYB1 569 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 FBXW7Q969H0 707 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCDC102AQ96A19 550 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 IRF6O14896 467 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP3K7O43318 606 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 RIMBP2O15034 1052 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PDE4DQ08499 809 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms