RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498163.1

RPL23AP55-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 55, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP55, Length 452 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP55-201ENST00000498163 CAMK2BQ13554 666 aa7.62□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.62□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 WDR70Q9NW82 654 aa7.62□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 KIF3CO14782 793 aa7.61□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 SEC24BO95487 1268 aa7.6□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 E2F4Q16254 413 aa7.59□□□□□ -1.19
RPL23AP55-201ENST00000498163 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 FOXK1P85037 733 aa7.57□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 NBR1Q14596 966 aa7.56□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.56□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.56□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 DSG2Q14126 1118 aa7.55□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 C2orf72A6NCS6 295 aa7.54□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 G3V3G9 751 aa7.54□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 TMC2Q8TDI7 906 aa7.54□□□□□ -1.2
RPL23AP55-201ENST00000498163 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.5□□□□□ -1.21
RPL23AP55-201ENST00000498163 POTEJP0CG39 1038 aa7.49□□□□□ -1.21
RPL23AP55-201ENST00000498163 PLPP6Q8IY26 295 aa7.49□□□□□ -1.21
RPL23AP55-201ENST00000498163 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.48□□□□□ -1.21
RPL23AP55-201ENST00000498163 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RPL23AP55-201ENST00000498163 POTEB2H3BUK9 544 aa7.47□□□□□ -1.21
RPL23AP55-201ENST00000498163 SLC34A2O95436 690 aa7.45□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 PDIA6Q15084 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 OXER1Q8TDS5 423 aa7.45□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 SEMA3EO15041 775 aa7.43□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 DPYSL4O14531 572 aa7.42□□□□□ -1.22
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.39□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 PTGER2P43116 358 aa7.38□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.38□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.38□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.37□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.36□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAP3K9P80192 1104 aa7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RPL23AP55-201ENST00000498163 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.33□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 TBC1D12O60347 775 aa7.32□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 EVI5O60447 810 aa7.32□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.32□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.32□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 OTUD5Q96G74 571 aa7.31□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 DOK7Q18PE1 504 aa7.3□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 OSBPP22059 807 aa7.29□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 GPR153Q6NV75 609 aa7.28□□□□□ -1.24
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 GPR37O15354 613 aa7.27□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 LHX8Q68G74 356 aa7.27□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZMYND10O75800 440 aa7.26□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 RIMBP2O15034 1052 aa7.25□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 SNPHO15079 494 aa7.25□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 PHF14O94880 888 aa7.25□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 DDX12PQ92771 950 aa7.25□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.24□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.24□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 JPH4Q96JJ6 628 aa7.24□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 EPAS1Q99814 870 aa7.24□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 FOSBP53539 338 aa7.23□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 ARSIQ5FYB1 569 aa7.23□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 BARGINQ6ZT62 677 aa7.23□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.23□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPL23AP55-201ENST00000498163 NUDT7P0C024 238 aa7.21□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 FBXW7Q969H0 707 aa7.21□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.2□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.2□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 PTGDRQ13258 359 aa7.18□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 HIC1Q14526 733 aa7.17□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 NUTM2FA1L443 756 aa7.16□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 FCHSD2O94868 740 aa7.16□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.16□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 LHX6Q9UPM6 363 aa7.16□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 GNPATO15228 680 aa7.15□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.15□□□□□ -1.26
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAP3K7O43318 606 aa7.14□□□□□ -1.27
RPL23AP55-201ENST00000498163 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPL23AP55-201ENST00000498163 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.14□□□□□ -1.27
RPL23AP55-201ENST00000498163 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.14□□□□□ -1.27
RPL23AP55-201ENST00000498163 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.14□□□□□ -1.27
RPL23AP55-201ENST00000498163 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAP2K5Q13163 448 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms