RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 TMC2Q8TDI7 906 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 OCEL1Q9H607 264 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 G3V3G9 751 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRC-212ENST00000491302 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRC-212ENST00000491302 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRC-212ENST00000491302 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRC-212ENST00000491302 FOXK1P85037 733 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRC-212ENST00000491302 DSG2Q14126 1118 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 PLCG2P16885 1265 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 POTEIP0CG38 1075 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 DPYSL4O14531 572 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYND10O75800 440 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 PDIA6Q15084 440 aa16■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 PLPP6Q8IY26 295 aa16■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf72A6NCS6 295 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 KIF3CO14782 793 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRC-212ENST00000491302 SEC24BO95487 1268 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 BARGINQ6ZT62 677 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K9P80192 1104 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRC-212ENST00000491302 NEUROD2Q15784 382 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A7Q92504 469 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRC-212ENST00000491302 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRC-212ENST00000491302 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRC-212ENST00000491302 C7P10643 843 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 AK7Q96M32 723 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 POTEFA5A3E0 1075 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D12O60347 775 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 OXER1Q8TDS5 423 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRC-212ENST00000491302 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRC-212ENST00000491302 PTGER2P43116 358 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRC-212ENST00000491302 METRNQ9UJH8 293 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRC-212ENST00000491302 NUTM2FA1L443 756 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRC-212ENST00000491302 GPR37O15354 613 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRC-212ENST00000491302 EVI5O60447 810 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRC-212ENST00000491302 OSBPP22059 807 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRC-212ENST00000491302 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRC-212ENST00000491302 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRC-212ENST00000491302 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM66O15016 1216 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 SLC34A2O95436 690 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 DDX12PQ92771 950 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 FCHSD2O94868 740 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 PDE4DQ08499 809 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 HIC1Q14526 733 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 GNPATO15228 680 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 MAP2K5Q13163 448 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-212ENST00000491302 POTEB2H3BUK9 544 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRC-212ENST00000491302 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRC-212ENST00000491302 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRC-212ENST00000491302 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRC-212ENST00000491302 IRF6O14896 467 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRC-212ENST00000491302 POTEJP0CG39 1038 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRC-212ENST00000491302 EPAS1Q99814 870 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC102AQ96A19 550 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRC-212ENST00000491302 PHF14O94880 888 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf37Q86TY3 774 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRC-212ENST00000491302 PTGDRQ13258 359 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRC-212ENST00000491302 IL27Q8NEV9 243 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRC-212ENST00000491302 AMHR2Q16671 573 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRC-212ENST00000491302 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRC-212ENST00000491302 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K7O43318 606 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRC-212ENST00000491302 FECHP22830 423 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRC-212ENST00000491302 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRC-212ENST00000491302 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRC-212ENST00000491302 FBXW7Q969H0 707 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRC-212ENST00000491302 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRC-212ENST00000491302 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRC-212ENST00000491302 JPH4Q96JJ6 628 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRC-212ENST00000491302 FAM117AQ9C073 453 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRC-212ENST00000491302 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
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