RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC24BO95487 1268 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 C7P10643 843 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TMC2Q8TDI7 906 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGGTB-205ENST00000462042 CAMK2BQ13554 666 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGGTB-205ENST00000462042 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
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RABGGTB-205ENST00000462042 FOXK1P85037 733 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGGTB-205ENST00000462042 METRNQ9UJH8 293 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 DSG2Q14126 1118 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 C2orf72A6NCS6 295 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF3CO14782 793 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEIP0CG38 1075 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEFA5A3E0 1075 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 PLPP6Q8IY26 295 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA3EO15041 775 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGGTB-205ENST00000462042 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 DPYSL4O14531 572 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 PDIA6Q15084 440 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K9P80192 1104 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D12O60347 775 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-205ENST00000462042 OXER1Q8TDS5 423 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC34A2O95436 690 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 PTGER2P43116 358 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGGTB-205ENST00000462042 EVI5O60447 810 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGGTB-205ENST00000462042 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGGTB-205ENST00000462042 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGGTB-205ENST00000462042 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGGTB-205ENST00000462042 ZMYND10O75800 440 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGGTB-205ENST00000462042 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RABGGTB-205ENST00000462042 BARGINQ6ZT62 677 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGGTB-205ENST00000462042 DOK7Q18PE1 504 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGGTB-205ENST00000462042 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.09□□□□□ -0.47
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX12PQ92771 950 aa12.09□□□□□ -0.47
RABGGTB-205ENST00000462042 RIMBP2O15034 1052 aa12.08□□□□□ -0.48
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RABGGTB-205ENST00000462042 POTEB2H3BUK9 544 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGGTB-205ENST00000462042 EPAS1Q99814 870 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGGTB-205ENST00000462042 NUTM2FA1L443 756 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF14O94880 888 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC24A3Q9HC58 644 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGGTB-205ENST00000462042 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGGTB-205ENST00000462042 AK7Q96M32 723 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 SNPHO15079 494 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 FCHSD2O94868 740 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 HIC1Q14526 733 aa12□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXW7Q969H0 707 aa12□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR37O15354 613 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 JPH4Q96JJ6 628 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 GNPATO15228 680 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K7O43318 606 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 FOSBP53539 338 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP2K5Q13163 448 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 ARSIQ5FYB1 569 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR153Q6NV75 609 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 PTGDRQ13258 359 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 NEUROD2Q15784 382 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT7P0C024 238 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 CERKQ8TCT0 537 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 IRF6O14896 467 aa11.88□□□□□ -0.51
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