RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 MSH5O43196 834 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 KCNA4P22459 653 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 GPATCH11Q8N954 259 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 NEFHP12036 1026 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 MCCP23508 829 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 BANK1Q8NDB2 785 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 DEF6Q9H4E7 631 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 GOLIM4O00461 696 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 TNNT1P13805 278 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-209ENST00000442510 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 TDO2P48775 406 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 PHF14O94880 888 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 ANAPC15P60006 121 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 KCNJ4P48050 445 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 RALBP1Q15311 655 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 KIF20AO95235 890 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 CASC1Q6TDU7 716 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 SOX12O15370 315 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 P3H3Q8IVL6 736 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 KIF3AQ9Y496 699 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 NFKBIBQ15653 356 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 TEX35Q5T0J7 233 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 STAC3Q96MF2 364 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 GPS2Q13227 327 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 TIGD1Q96MW7 591 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-209ENST00000442510 ESPNB1AK53 854 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 CTR9Q6PD62 1173 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 H0YHG0 523 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 TMCO5BA8MYB1 307 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 MNS1Q8NEH6 495 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 UQCRHP07919 91 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 CLCN1P35523 988 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 MRE11P49959 708 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 SETSIPP0DME0 302 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 CBX1P83916 185 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 PLCB2Q00722 1185 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 CERS3Q8IU89 383 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 USP8P40818 1118 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 LIG1P18858 919 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 CCP110O43303 1012 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 GBP4Q96PP9 640 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-209ENST00000442510 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-209ENST00000442510 ERICH4A6NGS2 130 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-209ENST00000442510 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-209ENST00000442510 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-209ENST00000442510 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.95□□□□□ -1.3
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